つまらない愚痴です

研究者であるならば、ワードぐらい使いこなしてください。せめて基本機能だけでもきちんとマスターしてください。ワードで論文を書くなら、ワードの入門書を片手に！
たとえばインデント機能を使わずに、空白など挿入されると見た目はたしかにインデントされています。けど、編集作業で、ちょっと一行の文字数や行数など変更すると、レイアウトが崩れるのですよ。編集者は直すのが面倒です。
最近のワープロには、きちんと注釈機能がついてます。注を挿入するなら、それを使ってください！